口腔微生态与系统性疾病研究平台现有实验空间700平米，平台分为4个区域：分子生物实验室、微生物实验室、细胞实验室、动物观察室。平台目前拥有荧光定量PCR仪、荧光倒置显微镜、体式显微镜、化学发光成像仪、生物安全柜、流式细胞仪、纯水仪、超低温冰箱、数控剪切流活细胞分析平台、超高分辨率小动物超声影像系统、心血管功能检测分析系统、自动化小鼠新陈代谢监测系统等一系列大型设备。

口腔微生态与系统性疾病研究平台，一方面探究微生物与宿主、微生物之间存在的相互制约和依赖关系；阐明口腔微生态体系特点及其与口腔疾病以及心血管疾病之间的关系，维持口腔微生态和机体各自之间的平衡。另一方面以口腔牙体牙髓科、牙周科为主导构建，重点围绕口腔高发病龋病、根尖周病、牙周病、以及粘膜病的病因学研究，选择牙菌斑生物膜为重点研究对象，采用代谢组学、蛋白组学和生物信息学等先进技术手段，聚焦口腔感染性疾病的关键致病机制。